Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps28P62858 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps28P62858 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms