Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg6P61406 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg6P61406 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg6P61406 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg6P61406 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms