Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms