Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms