Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdo1P60334 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdo1P60334 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdo1P60334 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdo1P60334 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms