Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms