Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms