Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf2P58021 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms