Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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NcstnP57716 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms