Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CartptP56388 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CartptP56388 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CartptP56388 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms