Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh5P55284 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms