Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms