Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms