Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms