Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms