Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TspoP50637 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TspoP50637 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TspoP50637 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TspoP50637 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TspoP50637 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TspoP50637 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms