Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms