Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdhaP50136 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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