Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms