Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms