Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms