Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VdrP48281 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VdrP48281 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VdrP48281 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms