Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
InaP46660 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
InaP46660 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
InaP46660 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
InaP46660 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
InaP46660 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
InaP46660 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms