Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms