Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk3P41971 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms