Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf9P41274 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tnfsf9P41274 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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