Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TfamP40630 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TfamP40630 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TfamP40630 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TfamP40630 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TfamP40630 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms