Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms