Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms