Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf2P39429 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf2P39429 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms