Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms