Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6fP35460 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6fP35460 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6fP35460 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6fP35460 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6fP35460 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms