Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms