Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc3P33622 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms