Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms