Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrm4P32211 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms