Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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