Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms