Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms