Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms