Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxraP28700 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms