Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn10P28658 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms