Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BgnP28653 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BgnP28653 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BgnP28653 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BgnP28653 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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