Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms