Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LoxP28301 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms