Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb3P28231 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms