Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms