Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms