Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RdxP26043 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RdxP26043 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RdxP26043 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms