Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms